Fenerbahçe futbol A takımı, 2025 yılında Süper Lig, UEFA Avrupa Ligi, Ziraat Türkiye Kupası ve UEFA Şampiyonlar Ligi elemelerinde toplam 58 maça çıktı. Bu mücadelelerde 35 galibiyet, 15 beraberlik ve 8 mağlubiyet aldı. Süper Lig'in 2025-2026 sezonunun ilk yarısını namağlup tamamlayan sarı-lacivertliler, 17 haftada 39 puan toplayarak ikinci sırada yer aldı. Lider Galatasaray'ın 3 puan gerisinde kalan takım, 39 gol atarak ligin en golcü ekiplerinden biri oldu.
Fenerbahçe'de eylül ayında gerçekleşen olağanüstü seçimli genel kurul, yeni bir dönemi başlattı. 20-21 Eylül tarihlerinde yapılan kongrede, 24 bin 393 geçerli oyun 12 bin 325'ini alan Sadettin Saran başkan seçildi. Rakibi Ali Koç ise 12 bin 68 oy aldı. Bu sonuçla Ali Koç'un 7 yıllık başkanlık dönemi sona erdi.
Jose Mourinho'nun Fenerbahçe'deki ikinci sezonu beklenenden kısa sürdü. UEFA Şampiyonlar Ligi'ne play-off aşamasında veda edilmesinin ardından, 29 Ağustos'ta yollar ayrıldı. Mourinho'nun yerine eylül ayında Domenico Tedesco getirildi. Tedesco yönetimindeki takım, Süper Lig'de çıktığı 14 maçta mağlubiyet yüzü görmedi ve 9 galibiyet, 5 beraberlik aldı.
Fenerbahçe, 2025 yılında Avrupa kupalarında çeyrek finalin eşiğinden döndü. UEFA Avrupa Ligi 2024-2025 sezonunda son 16 turunda Rangers ile eşleşti. İlk maçı 3-1 kaybeden sarı-lacivertliler, rövanşta 2-0 öne geçmesine rağmen uzatmalara giden maçı penaltılarla kaybetti. 2025-2026 sezonunda ise Şampiyonlar Ligi'nden elenen takım, Avrupa Ligi'nde 6 maçta 11 puan topladı.
Fenerbahçe, 2025'te kadrosunu önemli transferlerle güçlendirdi. Kulüp tarihinin en pahalı transferi, 22.5 milyon Euro bedelle Galatasaray'dan alınan Kerem Aktürkoğlu oldu. Forvet Youssef En-Nesyri, 2025 takvim yılında 29 gol kaydederek takımın en önemli golcüsü konumundaydı. Anderson Talisca ise hem Süper Lig'de Trabzonspor'a, hem de Avrupa Ligi'nde Norveç'in Brann takımına karşı hat-trick yaparak dikkat çekti.
Sarunas Jasikevicius yönetimindeki Fenerbahçe Beko, 2025'te tarihi bir başarıya imza attı. Euroleague'de finalde Monaco'yu 81-70 mağlup ederek ikinci şampiyonluğunu kazandı. Ayrıca Türkiye Kupası, Basketbol Süper Ligi ve Cumhurbaşkanlığı Kupası'nı da müzesine götüren takım, toplam 4 kupa kazandı. Kadın basketbol takımı ise ING Kadınlar Basketbol Süper Ligi'nde ÇBK Mersin'i seride 3-0 mağlup ederek üst üste 7. şampiyonluğunu elde etti.
Fenerbahçe, voleybol branşlarında da kupalarla tanıştı. Kadın voleybol takımı, AXA Sigorta Kupa Voley'de Eczacıbaşı Dynavit'i 3-0 yenerek 5. kez bu kupayı kazandı. Erkek voleybol takımı ise AXA Sigorta Kupa Voley'de Halkbank'ı 3-0 mağlup ederek şampiyon oldu ve CEV Kupası'na katılma hakkı elde etti.